开  放  /  共  享  /  交  叉  /  融  合

当前位置

生物信息学中心2022年首期培训班顺利举办

2022年01月21日 17:55

1月16-19日,3118com云顶集团生物信息学中心举办了2022年首期系列培训班,包括线下《全基因组关联分析培训》、《分子进化分析培训》和线上《BaseNumber-基于GPU加速的基因数据分析软件培训》。中心邀请了3118com云顶集团的甘祥超教授、农学院的贺建波博士、袁阳博士、南京大学的王龙博士作为主讲老师开展线下培训,共160余人次参加;邀请了赛乐基因生物信息总监葛平博士作为主讲老师进行线上培训,共50余人参加。

在线下《全基因组关联分析》培训课上,甘祥超教授简单回顾了数量遗传学及全基因组关联分析技术的发展历史,系统介绍了基于二代及三代测序平台的遗传变异检测的方法体系及工作流程,利用可视化工具展示和培训了系列软件工具的使用及分析结果的解读,并重点讲解了全基因组关联实验设计的注意事项;贺建波博士讲述了全基因组关联分析的基本原理、一般线性模型和混合线性模型方法的统计理论以及表型数据的统计分析方法,详细讲解了基因型数据描述统计、连锁不平衡分析、群体结构推断以及全基因组关联分析的计算程序,并分享了限制性两阶段多位点全基因组关联分析(RTM-GWAS)方法的设计理念、计算程序及其在遗传育种和群体进化研究中的应用。

1F96F

1F96F

在线下《分子进化分析》培训课上,袁阳博士介绍了序列比对,核苷酸替换模型,pi、ka/ks等进化参数的计算原理,进化树构建原理等,并通过一系列练习题,培训了Mega、Clustalw2、fasttree等相关软件的使用以及结果的数据分析和美化;王龙博士围绕基因组演化分析展开,介绍并演示了利用生物信息手段进行同源基因鉴定、共线性分析、全基因组比对、群体内及物种间受选择区域的鉴定、基于全基因组比对的物种系统发生关系构建与溯源等内容。

1F96F

1F96F

在线上《BaseNumber-基于GPU加速的基因数据分析软件》培训课上,赛乐基因的葛平博士介绍了GPU异构计算加速在生物信息领域应用的原理与优势;赛乐基因自研的BaseNumber DNA测序数据分析系统的胚系变异检测流程、产品性能指标和软件使用方法。

在培训课后答疑环节,多位学员针对自身科研工作及上机实际操作过程中的问题进行交流提问,主讲老师们一一进行了详实的解答指导,师生沟通充分,交流热烈,学术氛围浓厚。线下培训课后,主讲老师们还亲自向学员颁发了结业证书,培训班圆满结束。

本次系列培训班的举办提升了生命科学与生物信息学的学科交叉,帮助了我校师生,尤其是研究生新生利用生物信息学技术更好地开展科学研究,是一次全新的技术支持尝试。未来,生物信息学中心将会继续发挥自身优势,拓展培训渠道,为推进南农的学科交叉与创新贡献力量。


Baidu
sogou